Prodigal

高效的原核基因识别工具，使用动态规划算法自动学习物种特异性参数进行基因预测。该方法无需训练数据即可准确预测蛋白编码基因，支持宏基因组模式处理混合物种数据。

复杂度分析

性能洞见：该算法时间复杂度属于线性（O(n) 量级），可在 TB 级数据上线性扩展，适合流式处理。空间复杂度线性，通常可通过滑动窗口等技术在常数因子上优化。

注：复杂度基于理论模型。实际性能受数据规模、硬件环境与实现优化影响，建议针对具体场景进行基准测试。