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REGENIE

两阶段回归框架的大规模关联分析工具,先用全基因组回归预测个体的基因背景, 再进行逐位点的关联检验。该方法计算效率极高,适用于百万级别的生物银行数据。

属性
用途两阶段大规模全基因组关联分析
时间复杂度O(n * m)
空间复杂度O(n * m)
年份2021
难度进阶 (Intermediate)
实现语言C++
分类群体遗传学

复杂度分析

  • 时间复杂度O(n * m)
  • 空间复杂度O(n * m)

性能洞见:该算法时间复杂度属于多项式量级。

注:复杂度基于理论模型。实际性能受数据规模、硬件环境与实现优化影响,建议针对具体场景进行基准测试。

文献与实现

相关工具

BOLT-LMM · SAIGE · GCTA

标签

gwas scalable two-stage biobank

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