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Selscan

高效的选择信号扫描工具,实现基于单倍型的 iHS 和 XP-EHH 等经典选择检验 统计量。该方法可检测正在进行或近期完成的正选择事件。

属性
用途基于单倍型的选择信号检测
时间复杂度O(n * m)
空间复杂度O(n * m)
年份2014
难度进阶 (Intermediate)
实现语言C++
分类群体遗传学

复杂度分析

  • 时间复杂度O(n * m)
  • 空间复杂度O(n * m)

性能洞见:该算法时间复杂度属于多项式量级。

注:复杂度基于理论模型。实际性能受数据规模、硬件环境与实现优化影响,建议针对具体场景进行基准测试。

文献与实现

相关工具

SweeD · hapbin · CMS

标签

selection haplotype ihs xp-ehh

Released under the MIT License.