SPRING
专为 FASTQ 读段设计的无损压缩方法，通过重排序、基于参考的编码思想和质量值建模获得高压缩比。 该方法在大规模测序项目中能显著降低存储成本，是 FASTQ 专用压缩领域的重要代表工具。
| 属性 | 值 |
|---|---|
| 用途 | FASTQ 读段及质量值的高比率无损压缩 |
| 时间复杂度 | O(n) |
| 空间复杂度 | O(n) |
| 年份 | 2019 |
| 分类 | 数据压缩 |
复杂度分析
- 时间复杂度：
O(n) - 空间复杂度：
O(n)
性能洞见：该算法时间复杂度属于线性（O(n) 量级），可在 TB 级数据上线性扩展，适合流式处理。空间复杂度线性，通常可通过滑动窗口等技术在常数因子上优化。
注：复杂度基于理论模型。实际性能受数据规模、硬件环境与实现优化影响，建议针对具体场景进行基准测试。
文献与实现
相关工具
Genozip · gzip · fqzcomp