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Tajima's D

经典的中性检验统计量,通过比较核苷酸多样性与分离位点数来检测群体是否 偏离中性进化假设。负值提示正选择或群体扩张,正值提示平衡选择或群体收缩。

属性
用途检测群体是否偏离中性进化
时间复杂度O(n * L)
空间复杂度O(L)
年份1989
难度入门 (Beginner)
实现语言R、Python
分类群体遗传学

复杂度分析

  • 时间复杂度O(n * L)
  • 空间复杂度O(L)

性能洞见:该算法时间复杂度属于多项式量级。

注:复杂度基于理论模型。实际性能受数据规模、硬件环境与实现优化影响,建议针对具体场景进行基准测试。

文献与实现

相关工具

VCFtools · popgenome · scikit-allel

标签

neutrality-test selection classic population-genetics

Released under the MIT License.