Tajima's D
经典的中性检验统计量,通过比较核苷酸多样性与分离位点数来检测群体是否 偏离中性进化假设。负值提示正选择或群体扩张,正值提示平衡选择或群体收缩。
| 属性 | 值 |
|---|---|
| 用途 | 检测群体是否偏离中性进化 |
| 时间复杂度 | O(n * L) |
| 空间复杂度 | O(L) |
| 年份 | 1989 |
| 难度 | 入门 (Beginner) |
| 实现语言 | R、Python |
| 分类 | 群体遗传学 |
复杂度分析
- 时间复杂度:
O(n * L) - 空间复杂度:
O(L)
性能洞见:该算法时间复杂度属于多项式量级。
注:复杂度基于理论模型。实际性能受数据规模、硬件环境与实现优化影响,建议针对具体场景进行基准测试。
文献与实现
相关工具
VCFtools · popgenome · scikit-allel