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DSRC

面向 FASTQ 文件的专用压缩算法,分别针对序列、质量值和标识符设计编码策略以提升压缩效率。 该方法兼顾压缩速度和压缩率,适合高通量测序中心对海量原始读段数据进行归档与传输。

属性
用途FASTQ 数据的高速专用无损压缩
时间复杂度O(n)
空间复杂度O(1)
年份2013
分类数据压缩

复杂度分析

  • 时间复杂度O(n)
  • 空间复杂度O(1)

性能洞见:该算法时间复杂度属于线性(O(n) 量级),可在 TB 级数据上线性扩展,适合流式处理。空间开销极小,适合内存受限的嵌入式或流式场景。

注:复杂度基于理论模型。实际性能受数据规模、硬件环境与实现优化影响,建议针对具体场景进行基准测试。

文献与实现

相关工具

SPRING · Genozip · gzip

标签

fastq specialized-compression archival fast

Released under the MIT License.