基于局部重组装的变异检测算法，通过在活跃区域进行局部单倍型组装来发现变异。 该方法能够同时检测 SNP 和 Indel，是目前最广泛使用的变异检测工具之一。
| 属性 | 值 |
|---|---|
| 用途 | 检测 SNP 和小型 Indel 变异 |
| 时间复杂度 | O(n * r) |
| 空间复杂度 | O(r) |
| 年份 | 2010 |
| 分类 | 变异检测 |
O(n * r)O(r)性能洞见：该算法时间复杂度属于多项式量级。
注：复杂度基于理论模型。实际性能受数据规模、硬件环境与实现优化影响，建议针对具体场景进行基准测试。
GATK · Picard · BWA