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Genozip

专为基因组数据设计的高性能压缩工具,支持 FASTQ、BAM、VCF 等多种格式的无损压缩。 该方法利用基因组数据的特殊结构实现远超通用压缩的压缩比,支持随机访问和加密。

属性
用途基因组数据的高压缩比无损压缩
时间复杂度O(n)
空间复杂度O(1)
年份2021
分类数据压缩

复杂度分析

  • 时间复杂度O(n)
  • 空间复杂度O(1)

性能洞见:该算法时间复杂度属于线性(O(n) 量级),可在 TB 级数据上线性扩展,适合流式处理。空间开销极小,适合内存受限的嵌入式或流式场景。

注:复杂度基于理论模型。实际性能受数据规模、硬件环境与实现优化影响,建议针对具体场景进行基准测试。

文献与实现

相关工具

gzip · CRAM · Spring

标签

multi-format high-ratio random-access encryption

Released under the MIT License.