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HUMAnN

宏基因组功能分析流水线,将测序读段映射到基因家族和代谢通路,量化微生物群落的功能潜力。 该方法整合了物种分类和功能注释,能同时提供群落水平和物种水平的功能组成。

属性
用途宏基因组功能组成和代谢通路分析
时间复杂度O(n * d)
空间复杂度O(d)
年份2014
分类宏基因组学

复杂度分析

  • 时间复杂度O(n * d)
  • 空间复杂度O(d)

性能洞见:该算法时间复杂度属于多项式量级。

注:复杂度基于理论模型。实际性能受数据规模、硬件环境与实现优化影响,建议针对具体场景进行基准测试。

文献与实现

相关工具

MetaPhlAn · KEGG · eggNOG-mapper

标签

pathway-analysis gene-family functional pipeline

Released under the MIT License.