QUAST
基因组组装质量评估工具，计算 contig N50、scaffold N50、错配率和完整性等指标。该工具支持无参考和有参考的评估，是组装结果评价的标准工具。
| 属性 | 值 |
|---|---|
| 用途 | 基因组组装质量的综合评估 |
| 时间复杂度 | O(n * r) |
| 空间复杂度 | O(n) |
| 年份 | 2013 |
| 难度 | 入门 (Beginner) |
| 实现语言 | Python |
| 分类 | 序列组装 |
复杂度分析
- 时间复杂度：
O(n * r) - 空间复杂度：
O(n)
性能洞见：该算法时间复杂度属于多项式量级。空间复杂度线性，通常可通过滑动窗口等技术在常数因子上优化。
注：复杂度基于理论模型。实际性能受数据规模、硬件环境与实现优化影响，建议针对具体场景进行基准测试。
文献与实现
相关工具
BUSCO · Merqury · Inspector