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Squidpy

专注于空间组学数据分析的 Python 工具包,提供空间邻域图构建、空间富集分析、 细胞通讯推断和图像分析等功能。该工具与 Scanpy 深度集成,支持多种空间平台。

属性
用途空间组学数据的图分析和图像整合
时间复杂度O(c * g)
空间复杂度O(c * g)
年份2021
难度进阶 (Intermediate)
实现语言Python
分类空间组学

复杂度分析

  • 时间复杂度O(c * g)
  • 空间复杂度O(c * g)

性能洞见:该算法时间复杂度属于多项式量级。

注:复杂度基于理论模型。实际性能受数据规模、硬件环境与实现优化影响,建议针对具体场景进行基准测试。

文献与实现

相关工具

Scanpy · Giotto · stLearn

标签

spatial graph-analysis cell-interaction image-analysis

Released under the MIT License.