使用指南

欢迎来到 bwa-rust 使用指南。

指南目录

章节	说明
安装	系统要求、构建步骤、预编译二进制
快速开始	基础用法、CLI 参数详解、功能概览

快速导航

新用户

1. 安装 — 确保系统满足要求并完成安装
2. 快速开始 — 学习基础用法和常用参数

开发者

• 架构文档 — 了解内部实现和算法
• API 文档 — 查看 Rust API 参考
• GitHub — 源码和 Issue

命令速查

# 构建索引
bwa-rust index reference.fa -o ref

# 比对序列（使用索引）
bwa-rust align -i ref.fm reads.fq -o output.sam

# 一步比对（BWA-MEM 风格）
bwa-rust mem reference.fa reads.fq -t 8 -o output.sam

系统要求

• Rust: 1.70+ (MSRV)
• 平台: Linux / macOS / Windows
• 内存: 建议 8GB+（人类基因组索引构建）