MuTect2
GATK 中的体细胞变异检测工具，通过贝叶斯统计模型同时检测肿瘤样本中的体细胞 SNP 和小型 Indel。 该方法利用匹配的正常组织样本进行背景噪声去除，广泛应用于癌症基因组学研究与临床肿瘤检测。
| 属性 | 值 |
|---|---|
| 用途 | 检测体细胞 SNP 和小型 Indel 变异 |
| 时间复杂度 | O(n * r) |
| 空间复杂度 | O(r) |
| 年份 | 2013 |
| 分类 | 变异检测 |
复杂度分析
- 时间复杂度：
O(n * r) - 空间复杂度：
O(r)
性能洞见：该算法时间复杂度属于多项式量级。
注：复杂度基于理论模型。实际性能受数据规模、硬件环境与实现优化影响，建议针对具体场景进行基准测试。
文献与实现
相关工具
GATK · Strelka2 · VarScan2