书目与仓库

把这一页当作公开文档集的引文索引。

编号文献

1. [R1] Chandak 等，SPRING: a next-generation compressor for FASTQ files。
   最接近 assembly-based compression、可逆重排与共识式序列压缩框架的论文来源。
2. [R2] Bonfield，fqzcomp 仓库。
   一个紧凑的质量值压缩参考，用来迫使我们正视流级编码取舍。
3. [R3] Sahlin 等，NanoSpring: reference-free lossless compression of nanopore sequencing reads。
   在解释 fq-compressor 没有首先围绕长读长场景优化时非常有用。

对照仓库

1. [C1] shubhamchandak94/Spring
   assembly-based compression 框架最接近的外部仓库参考。
2. [C2] shubhamchandak94/HARC
   适合比较 FASTQ 专用压缩器的架构和项目范围。
3. [C3] jkbonfield/fqzcomp
   用来检验 fq-compressor 质量值流拆分是否合理的重要对照。
4. [C4] qm2/NanoSpring
   用来说明长读长方向边界的对照对象。

仓库内证据锚点

1. [E1] benchmark/results/
   性能部分使用的机器可读和叙事型 benchmark 产物。
2. [E2] vendor/spring-core/
   带有明确许可边界的 Spring 派生参考代码。
3. [E3] ref-projects/
   本地对照目标和学习记录。
4. [E4] docs/archive/
   仅保留历史研究和规格材料，供参考使用。