参考文献
把这一页当作公开文档集的参考文献表。
论文
| 主题 | 参考文献 | 为什么和这里相关 |
|---|---|---|
| assembly-based compression | Chandak 等, SPRING: a next-generation compressor for FASTQ files | 是 ABC 风格 read ordering 与 consensus 推理最接近的论文框架 |
| 长读长对照 | Sahlin 等, NanoSpring: reference-free lossless compression of nanopore sequencing reads | 有助于解释 fq-compressor 为什么没有按 nanopore-first 假设来组织 |
仓库
| 仓库 | 在阅读路径中的角色 |
|---|---|
| shubhamchandak94/Spring | assembly-based compression 框架最接近的外部参考 |
| jkbonfield/fqzcomp | 紧凑的质量值压缩参考 |
| shubhamchandak94/HARC | 另一个 FASTQ 专用对照对象 |
| qm2/NanoSpring | 长读长方向对照 |